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用于同线性测定与大尺度定位分子标记的发展与优化,1.7万字 42页 原创作品,已通过查重系统摘要拟南芥是十字花科植物是研究有花植物的遗传、细胞、发育、分子生物学研究的模式植物。拟南芥很容易进行人工诱变产生大量突变体所以我们利用拟南芥作为实验材料。而研究方法,我们采用图位克隆的方法,从传统的正向遗传学入手进行我们的研究。图...
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分类: 论文>生物/化学论文

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用于同线性测定与大尺度定位分子标记的发展与优化

1.7万字 42页 原创作品,已通过查重系统


摘 要
拟南芥是十字花科植物是研究有花植物的遗传、细胞、发育、分子生物学研究的模式植物。拟南芥很容易进行人工诱变产生大量突变体所以我们利用拟南芥作为实验材料。而研究方法,我们采用图位克隆的方法,从传统的正向遗传学入手进行我们的研究。
图位克隆首先进行同线性测定与大尺度定位,然后利用3点测验进行精细定位以克隆基因。果荚突变体来源于EMS诱变,图位克隆是这类突变体分析所必需的。我们实验的目的就是优化用于同线性测定与大尺度定位的的分子标记实验条件,建立拟南芥EMS突变体快速同线性测定试验平台。
我们准备Ler、Col、F1(Ler x Col) DNA样品作为对照,样品为EMS诱变Ler 生态型得到拟南芥突变体32与Col野生型杂交、自交得到F2提取相应DNA。随后对9个分子标记探索他们最适PCR的条件,其中包括MgCl2的浓度以及退火温度等。在PCR产物检测我们比较PAGE凝胶和琼脂糖胶的优劣。实验结果表明:(1)NGA1107、E5418、E10019 1.5 mM MgCl2退火温度55℃;NGA6 1.5 mM MgCl2退火温度50℃;CIW5 2.0 mM MgCl2退火温度55℃;NGA8 2.0 mM MgCl2退火温度55℃;CIW7 1.5 mM MgCl2退火温度50℃;CIW9 2.0 mM MgCl2退火温度55℃。(2)PAGE分辨率高、上样少、花费低,但操作困难。琼脂糖分辨率稍低、上样多、花费高,但操作简单。权衡利弊,并参考实验结果,我们发现琼脂糖凝胶效果好。随后利用上述标记对8999突变体进行同线性测定,来检验回收的结果。本实验主要解决的问题是用于同线性测定与大尺度定位分子标记的发展与优化。
结果发现CIW7存在连锁。但其他8种分子标记不存在连锁。因为拟南芥5条染色体至少需要20个分子标记,所以我们要用更多的分子标记,更多的反应条件,来精确实验。


关键词:拟南芥;图位克隆;分子标记