clostridium phytofermentans木糖异构酶基因的克隆及分析.doc
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clostridium phytofermentans木糖异构酶基因的克隆及分析,clostridium phytofermentans木糖异构酶基因的克隆及分析1.48万字 40页原创作品,已通过查重系统摘要生物质乙醇是良好的化石能源替代品,作为一种可再生能源,其比化石能源更清洁,能有效减少温室气体的排放。生物质乙醇的生产原料来源于木质纤维素等物质。木质纤维素原料丰富,而且价格低廉,因此,利用木质...
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Clostridium phytofermentans木糖异构酶基因的克隆及分析
1.48万字 40页 原创作品,已通过查重系统
摘 要
生物质乙醇是良好的化石能源替代品,作为一种可再生能源,其比化石能源更清洁,能有效减少温室气体的排放。生物质乙醇的生产原料来源于木质纤维素等物质。木质纤维素原料丰富,而且价格低廉,因此,利用木质纤维素类物质为原料生产乙醇非常有前景。生物转化法生产乙醇以其利用再生资源、对环境污染小,反应条件温和,操作简单,副产物少等优点正越来越受到人们的重视。而木糖异构酶是控制木糖代谢生产乙醇的关键性限速酶,对乙醇的转化速率和产量起着至关重要的作用。从宏基因组中克隆表达木糖异构酶基因,不但可以丰富该酶基因资源,而且可以为工程菌法生产乙醇提供技术支撑。
论文利用PCR技术成功从宏基因组DNA中扩增得到与C. phytofermentans木糖异构酶基因大小相符的片段,片段大小为1317bp,测序后在Blast上进行比对,结果显示与编号为No. CP000885.1的C. phytofermentans木糖异构酶基因相似度为100%,其氨基酸序列在Blast上进行相似性比对,与GenBank 已公布的YP 001558336.1的C. phytofermentans ISDg的木糖异构酶的氨基酸相似性为100%,最终确定该片段为C. phytofermentans的xylA基因。通过生物信息学手段对C. phytofermentans的木糖异构酶基因进行了序列分析,结果显示该基因的起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,序列包含有7个潜在的ORF编码信息,C的百分比和G的百分比总和大于50.00%,并发现不能切割此序列的常用限制性内切酶有BamHISacIHindIII SmaI XhoI PstI。通过生物信息学对C. phytofermentans木糖异构酶的氨基酸序列进行了分析,结果显示该酶含有二十种氨基酸,蛋白质分子量为48713.0Da,理论等电点为5.10。蛋白质的最高疏水值MAX=1.878最低疏水值MIN=-2.867。蛋白质二级结构中,α-螺旋氨基酸数目为224,β-转角氨基酸数目为33,延伸链氨基酸数目为45,随机螺旋氨基酸数目为136。
关键词:克隆;木糖异构酶;宏基因组;Clostridium phytofermentans;分析
1.48万字 40页 原创作品,已通过查重系统
摘 要
生物质乙醇是良好的化石能源替代品,作为一种可再生能源,其比化石能源更清洁,能有效减少温室气体的排放。生物质乙醇的生产原料来源于木质纤维素等物质。木质纤维素原料丰富,而且价格低廉,因此,利用木质纤维素类物质为原料生产乙醇非常有前景。生物转化法生产乙醇以其利用再生资源、对环境污染小,反应条件温和,操作简单,副产物少等优点正越来越受到人们的重视。而木糖异构酶是控制木糖代谢生产乙醇的关键性限速酶,对乙醇的转化速率和产量起着至关重要的作用。从宏基因组中克隆表达木糖异构酶基因,不但可以丰富该酶基因资源,而且可以为工程菌法生产乙醇提供技术支撑。
论文利用PCR技术成功从宏基因组DNA中扩增得到与C. phytofermentans木糖异构酶基因大小相符的片段,片段大小为1317bp,测序后在Blast上进行比对,结果显示与编号为No. CP000885.1的C. phytofermentans木糖异构酶基因相似度为100%,其氨基酸序列在Blast上进行相似性比对,与GenBank 已公布的YP 001558336.1的C. phytofermentans ISDg的木糖异构酶的氨基酸相似性为100%,最终确定该片段为C. phytofermentans的xylA基因。通过生物信息学手段对C. phytofermentans的木糖异构酶基因进行了序列分析,结果显示该基因的起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,序列包含有7个潜在的ORF编码信息,C的百分比和G的百分比总和大于50.00%,并发现不能切割此序列的常用限制性内切酶有BamHISacIHindIII SmaI XhoI PstI。通过生物信息学对C. phytofermentans木糖异构酶的氨基酸序列进行了分析,结果显示该酶含有二十种氨基酸,蛋白质分子量为48713.0Da,理论等电点为5.10。蛋白质的最高疏水值MAX=1.878最低疏水值MIN=-2.867。蛋白质二级结构中,α-螺旋氨基酸数目为224,β-转角氨基酸数目为33,延伸链氨基酸数目为45,随机螺旋氨基酸数目为136。
关键词:克隆;木糖异构酶;宏基因组;Clostridium phytofermentans;分析