小蜜蜂bhlh转录因子家族成员鉴定.doc

  
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小蜜蜂bhlh转录因子家族成员鉴定,小蜜蜂bhlh转录因子家族成员鉴定9159字30页原创作品,已通过查重系统 摘要bhlh(basic helix-loop-helix 碱性螺旋-环-螺旋)转录因子在生长发育调控过程中起着重要的作用。动物bhlh因其调控基因表达的功能不同而被分成45个家族;此外,根据它们所作用dna元件和自身结构特点又被分成6个组:a...
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分类: 论文>生物/化学论文

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小蜜蜂bHLH转录因子家族成员鉴定

9159字 30页 原创作品,已通过查重系统


摘要
bHLH(basic helix-loop-helix 碱性螺旋-环-螺旋)转录因子在生长发育调控过程中起着重要的作用。动物bHLH因其调控基因表达的功能不同而被分成45个家族;此外,根据它们所作用DNA元件和自身结构特点又被分成6个组:A组参与调控神经元发生、肌细胞生成等。B组参与着细胞增殖、脂肪细胞形成等。C组参与着气管发育、激活环境毒素响应的调控。E组的两个家族参与调控胚胎分节、体节形成与器官发生等; F组仅有的1个家族参与着头部发育、嗅觉细胞等。迄今为止,基因组中的bHLH家族成员已得到鉴定的生物共有20种动物有17种、植物有2种、另外酵母也有1种。
小蜜蜂(Apis florea)基因组测序已经完成,而其bHLH家族成员尚未得到鉴定。本研究对小蜜蜂基因组中bHLH基因家族成员进行了分析,通过tBlastn用已知的45条bHLH转录因子的蛋白质序列在小蜜蜂基因组内进行搜索,得到相关可能的序列后,进行整理、比对、校正和分析,再与现已知的小蜜蜂蛋白质序列库中的数据进行比对,最后通过构建进化树进行家族归属判断,得出小蜜蜂基因组中具有41个编码bHLH蛋白的区域,分别有20、10、6、2、2和1个成员分别属于A、B、C、D、E和F组。此外,在小蜜蜂基因组中没有发现E12/E47、MyoD、HAND、Delilah、SCL、Myc、USF、MITF、AP4、SRC、HIF及EMC家族bHLH蛋白编码的基因区域。本研究为今后对小蜜蜂基因家族的研究做出了良好的铺垫同时该研究也为深入分析小蜜蜂bHLH蛋白的结构提供背景资料。

关键词:碱性螺旋-环-螺旋转录因子;小蜜蜂(Apis florea);基因组;系统进化