西方捕食螨bhlh转录因子家族成员鉴定.doc

西方捕食螨bHLH转录因子家族成员鉴定

1.1万字 24页 原创作品，已通过查重系统

摘 要
在真核生物中，bHLH转录因子对生长发育调控起到重要作用 这些转录因子组成了一个大家族。至今已经在20多种生物基因组中鉴定了bHLH家族的成员 其中动物有17 种、植物有2种、酵母有1种。动物bHLH因其调控基因表达的功能不同而被分成45个家族。我们所要研究的西方捕食螨也是动物的一种。动物bHLH转录因子分别参与调控神经元发生、肌细胞生成、肠组织发育以及环境毒素响应等生物学过程。
西方捕食螨（metaseiulus occidentalis）基因组测序已经完成，而其bHLH家族成员尚未得到鉴定。本研究对西方捕食螨基因组中bHLH基因家族成员进行分析，取得的结果有助于对西方捕食螨bHLH转录因子的进一步研究。
通过已知的45条bHLH转录因子的蛋白质序列在西方捕食螨基因组内进行tBlastn搜索，得到相关可能的序列后，进行整理、比对、校正和分析，再与现已知的西方捕食螨蛋白质序列库中的数据进行比对，最后通过构建进化树进行家族归属判断，最终得出西方捕食螨基因组中具有38个编码bHLH蛋白的区域，分别有12、8、5、1、1和1个成员分别属于A、B、C、D、E和F组。此外，在西方捕食螨基因组中没有Mesp、Paraxis、Max、MITF、AP4、TF4、MLX、SRC、HIF、BMAL及COE家族bHLH蛋白编码的基因区域。以上结果为进一步开展西方捕食螨bHLH结构与功能的研究打下了良好基础。


关键词：西方捕食螨，bHLH转录因子，blast搜索，内含子，进化树 多序列比对