利用一组sslp分子标记对几个果荚发育突变体进行初步定位.doc
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利用一组sslp分子标记对几个果荚发育突变体进行初步定位,利用一组sslp分子标记对几个果荚发育突变体进行初步定位1.7万字37页 原创作品,已通过查重系统摘要拟南芥是植物科学模式生物之一。它在实验室里易于栽种,并且生长周期只有6~8周,短时间的培育给遗传研究带来了很大的便利。我们通过诱变分离拟南芥果荚突变体,通过系列突变体分析全面解析果荚发育的生物学途径。果荚发育是发育生物...
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利用一组SSLP分子标记对几个果荚发育突变体进行初步定位
1.7万字 37页 原创作品,已通过查重系统
摘 要
拟南芥是植物科学模式生物之一。它在实验室里易于栽种,并且生长周期只有6~8周,短时间的培育给遗传研究带来了很大的便利。我们通过诱变分离拟南芥果荚突变体,通过系列突变体分析全面解析果荚发育的生物学途径。果荚发育是发育生物学研究的热点,发育过程涉及细胞分化、生殖、信号传到等基本的生物学问题,因此果荚发育的研究具有重要的理论意义。
理化突变体的定位克隆首先要进行同线性测定、大尺度定位以及精细定位等过程才能克隆基因。在大尺度定位中常常采用作图群体偏分离混合DNA样品的基因型检测进行初步的同线性测定,然后进行单株的基因型检测进行验证以确定与突变体连锁的分子标记。因此我们首先选择一组分子标记,对他们的工作条件进行优化,如引物浓度、d NTP浓度、MgCl2浓度以及退火温度。经优化,最终确定NGA63、NGA392、NGA280、CIW2、CIW3、NGA168、C4586、CIW11扩增退火温度采用50 ℃,40 s,2.0mM MgCl2;而NGA111与CIW4是55 ℃,40 s,1.5mM MgCl2。
拟利用这些分子标记对13号、16号、32号、34号、19号与28号突变体进行同线性测定,结果显示13号突变体与NGA63分子标记可能连锁,16号突变体与NGA392分子标记可能连锁,32号突变体与CIW3分子标记可能连锁,28号突变体与CIW2、CIW11分子标记可能连锁。然后对13号突变体进行单株基因型分析,初步定位的结果得到确证,即13号突变体与NGA63连锁,其交换律是46.1%。
对于初步判定的4个突变体,其中13号突变体可以进行定位的后续工作,其他3个突变体还需进行单株验证工作。此外,对于同线性测定而言还需选择第4与5染色体若干分子标记进行条件优化,完善同线性测定试验平台。
关键词:拟南芥;SSLP;图位克隆;同线性测定;果荚突变体
1.7万字 37页 原创作品,已通过查重系统
摘 要
拟南芥是植物科学模式生物之一。它在实验室里易于栽种,并且生长周期只有6~8周,短时间的培育给遗传研究带来了很大的便利。我们通过诱变分离拟南芥果荚突变体,通过系列突变体分析全面解析果荚发育的生物学途径。果荚发育是发育生物学研究的热点,发育过程涉及细胞分化、生殖、信号传到等基本的生物学问题,因此果荚发育的研究具有重要的理论意义。
理化突变体的定位克隆首先要进行同线性测定、大尺度定位以及精细定位等过程才能克隆基因。在大尺度定位中常常采用作图群体偏分离混合DNA样品的基因型检测进行初步的同线性测定,然后进行单株的基因型检测进行验证以确定与突变体连锁的分子标记。因此我们首先选择一组分子标记,对他们的工作条件进行优化,如引物浓度、d NTP浓度、MgCl2浓度以及退火温度。经优化,最终确定NGA63、NGA392、NGA280、CIW2、CIW3、NGA168、C4586、CIW11扩增退火温度采用50 ℃,40 s,2.0mM MgCl2;而NGA111与CIW4是55 ℃,40 s,1.5mM MgCl2。
拟利用这些分子标记对13号、16号、32号、34号、19号与28号突变体进行同线性测定,结果显示13号突变体与NGA63分子标记可能连锁,16号突变体与NGA392分子标记可能连锁,32号突变体与CIW3分子标记可能连锁,28号突变体与CIW2、CIW11分子标记可能连锁。然后对13号突变体进行单株基因型分析,初步定位的结果得到确证,即13号突变体与NGA63连锁,其交换律是46.1%。
对于初步判定的4个突变体,其中13号突变体可以进行定位的后续工作,其他3个突变体还需进行单株验证工作。此外,对于同线性测定而言还需选择第4与5染色体若干分子标记进行条件优化,完善同线性测定试验平台。
关键词:拟南芥;SSLP;图位克隆;同线性测定;果荚突变体